技 术 问 题


一、什么是DOTa/DOTr癌蛋白检测?

答:DoTa/DoTr检测是以检测肿瘤异常激活癌蛋白及其构成的肿瘤检查点,并精准匹配靶向药物的全球专利技术,检测包括三个步骤:

1、对肿瘤组织进行全转录组(RNA-seq)的高通量测序;

2、以美国VIPER专利技术,精准捕获(定量)异常活性的癌蛋白及主调控蛋白(肿瘤检查点);

3、按药物的有效性,精准匹配靶向癌蛋白的药物,并使肿瘤检查点“塌陷”,从而实现从“(药物)蛋白到(肿瘤)蛋白”的更直接、更精准的靶向治疗。

该项技术已得到Nature、Cell、新英格兰杂志等权威科学的发表及认可,发明人美国哥伦比亚大学Califano教授因此获得“美国国家科学院院士”。



二、DOTa/DOTr癌蛋白检测有什么临床意义?

答:目前,在肿瘤精准治疗中仅有25%者可检出可抑制突变,而其中又仅有50%对治疗有反应。如(一)所述,DoTa/DoTr检测无需检测基因突变情况,而是通过检测癌蛋白的异常活性及主调控蛋白(肿瘤检查点),匹配可以抑制它们的靶向药及化疗药物,首次实现从“(药物)蛋白到(肿瘤)蛋白”的更直接、更精准的靶向治疗,避免“盲目“试药,为临床无可抑制突变的患者提供了可靠的精准治疗方案。



三、如何检测癌蛋白的异常活性?

答:蛋白组学以“丰度”判断蛋白质活性,有很大的局限性和不足。蛋白质丰度只是细胞调节蛋白质活性的一种方式,蛋白质丰度可能与蛋白质活性有关,但只限于某些特定蛋白质和特定环境。蛋白质丰度体现的是蛋白质的数量,并非活性。

从生物学角度看,mRNA水平代表基因表达的中间状态,能代表潜在的蛋白质表达情况。转录组测序能在较低能耗下实现较高的通量、分辨率和灵敏度,利用转录组数据建立蛋白搜索数据库,将大大提升肽段及蛋白质的鉴定数量,平均可以增加蛋白鉴定数量20%-50%,这说明采用转录组比采用蛋白质组有可能获得更多的信息。

DOTa/DOTr检测通过RNA-Seq,获得RNA的表达量,以 VIPER专利技术推断癌蛋白的活性是否异常(过度表达&被抑制),并找出肿瘤检查点,匹配把向它们的药物。



四、癌蛋白检测的重要性

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五、DOTa/DOTr检测步骤:

全转录组测序 对肿瘤组织进行全转录组(RNA-seq)的高通量测序;
精准捕获 以美国VIPER专利技术,精准捕获(定量)异常活性的癌蛋白及主调控蛋白(肿瘤检查点);
精准匹配

精准匹配靶向癌蛋白的药物,使肿瘤检查点“塌陷”实现从“(药物)蛋白到(肿瘤)蛋白”的更直接更精准的靶向治疗。



六、DOTa/DOTr癌蛋白检测优势?

答:以蛋白质为核心的检测靶标,无需检测基因突变情况,是精准医疗新突破、实现癌细胞生物特征与药物机制的直接对应、比基因更深入,更全面、更精准,解决了大部分肿瘤,由于缺乏可抑制的突变(基因),而无法开展精准治疗的难点。

(DOTa/DOTr检测技术突破基因突变的范畴,不仅仅涵盖了癌症来源的起始端--基因突变,更是将突变基因及其相互关联,以及转录及翻译的影响均纳入其中,是对癌蛋白形成路径全程监测,在癌症形成的最后步骤--蛋白质水平上进行监控检测,通过检测每癌症个患者个体差异的异常蛋白活性,特异性的匹配最适合癌症患者治疗药物,实现以癌蛋白为靶点的更精准、更全面靶向治疗。

DOTa/DOTr靶向药范围包括了靶向基因药物在内的、对癌蛋白形成路径能产生抑制的所有药物,并将根据国内外的药品审批情况将定期更新。目前,DOTa/DOTr检测匹配药物库包含包括NMPA与FDA已批准的抗肿瘤药物, 总计178种;可能在五年内批准或仍处于临床试验阶段的抗肿瘤药物,总计近800种。)原来

 



七、为什么蛋白检测优于基因检测?

基因检测的局限性:不能覆盖RNA及蛋白层面,缺少多基因之间关联及转录与翻译过程改变;癌症是多基因突变的结果,目前仅在肺癌、乳腺癌及结直肠癌中发现较多的可被药物抑制的基因突变,还存在着众多没有可以被药物抑制的基因突变。



八、DOTa/DOTr检测VS基因检测项目的区别?

DOTa/DOTr检测基因检测
  • 精准获取6449个异常活性癌蛋白活性报告;

  • DOTa检测401个可药物抑制的癌蛋白(主要是信号蛋白),DOTr检测从2556个转录因子找出主调控蛋白;

-检测200余个驱动基因;

-检测80余个可药物抑制的基因;

  • 匹配180余种国内上市的靶向药及化疗药,其中包含所有国内上市的基因靶向药。

-匹配近100种国内外/上市的靶向药

答:在美国:DOTa/DOTr检测项目获得纽约卫生部批准,并取得CLIA认证实验室授权,广泛应用于临床,包括:哥伦比亚大学医学中心等, CLIA认证代表了目前国际最高水平的认证标准,实验室的LDTs项目可以 在CLIA实验室范围内提供分子检测业务以指导临床,而无需FDA批准。



九、DoTa/DoTr检测技术的资质问题?

在中国:DOTa/DOTr检测项目中NGS技术的测序仪器,检测试剂均已获得药监部门批准,并在国有控股厦门生物港临床医学检验中心完成检测,该中心已取得第三方医学检验资质。

 



临 床 问 题


一、DNA基因检测有假阴性报告率,哪美国DOTa\DOTr检测是否也会出现假阴性报告?出现概率是多少?出现的原因是哪些造成?如何处理?

答:基因检测只匹配有药物抑制的突变基因,所以针对靶点少的癌种,基因检测的假阴性概率很高;但我们DOTA/DOTR检测,检测的是异常活性的癌蛋白,可以精准检测出有药物抑制的癌蛋白。只要是癌症就必定存在异常激活的癌蛋白。目前,基因只能检测80余个可药物抑制的基因,DOTa可检测401个可药物抑制的癌蛋白(主要是信号蛋白),DOTr可从2559个转录因子检测出主调控蛋白;因此DOTA/DOTR假阴性率远低于基因检测。



二、DNA基因检测与美国DOTa/DOTr检测相比,哪个准确率更高,分别是多少?

答:目前最新一代的基因检测与DOTA/DOTR检测,均采用二代测序技术,从测序层面来说,准确率是一样的,但对测序结果的解读的范围和准确性,DOTA/DOTR具有明显的优势。



三、DNA基因有进入有NCCN指南,美国DOTa/DOTr有吗?

答:基因检测仅有约10个驱动基因出现在NCCN指南中,大部份基因突变也是参考药物说明书、专家共识、会议共识、文献以及临床研究数据。而DOTA/DOTR作为最新技术,目前在美国顶级癌症专科医院广泛应用于临床,并以发表多篇顶级学术文献,在中国DOTA/DOTR也在多家顶级医院进行多中心课题研究,将尽快形成在胃癌、食管癌、三阴型乳腺癌、肺癌、结直肠癌的专家共识。



四、DNA基因检测出具的报告有化疗药物用药提示汇总及解析,美国DOTa/DOTr检测报告是否有?

答:基因检测匹配的化疗药物是基于遗传基因进行解析,只解析化疗药物与检测本人是否敏感,与疾病及其治疗本身无关;而DOTA/DOTR检测所匹配的化疗药物,是基于异常活性的癌蛋白进行匹配,所匹配的药物可精准“靶向”异常的癌蛋白,进行精准治疗。



五、DNA基因检测是按位点收费,收费低;而美国DOTa/DOTr检测收费过高,接受的患者相比少。

答:基因检测只对癌症相关联的已知基因进行检测,对未知基因或致病不明确的基因不检测。基因检测是多个单独的DNA层面,不解析突变基因之间的相互关联,也不解析RNA及蛋白层面,所以可以拆成小套餐或按位点收费。但DOTA/DOTR检测,是通过RNA全转录组的测序,检测出所有异常活性癌蛋白及构成的主调控蛋白,然后匹配靶向它们的药物,实现更全面、更深入的靶向治疗。所以,DOTA/DOTR相比较于基因拆分检测,更有利于治疗目的。



六、美国DOTa/DOTr检测报告中所说总计166种药物是指哪些?其中是否包含化疗药?同时与彩页资料对比,彩页中DOTa标注已上市靶向药物是173种?DOTr标注已上市靶向药物是178种?

答:肿瘤亚型不同,对应可用的药物及数量也不同,报告中所匹配的药物是靶向药+化疗药;

报告或彩页中药物数量经常变化的原因在于:药物库的持续更新,所以对应的药物数会变化,但数量是在不断增加的。

DOTA/DOTR手册或折页中体现的药物数量接近800种,是因为这覆盖了国内外已上市的近180种药物(持续更新中)及近600种的国内外即将上市或正在研发中的药物(持续更新)。



七、以三阴性乳腺癌为例,如果通过一线以及多线治疗无良好预期情况下,再做DOTa/DOTr所推荐用药作为治疗,这样的治疗有效率是多少?有无相关依据?

 答:目前癌症治疗,更多的是基于标准治疗方案、NCCN指南、共识及经验进行治疗,而基因靶向治疗只检测DNA层面,不涉及RNA及蛋白质层面,其客观缓解率(ORR)大概在5%左右; DOTA/DOTR检测,是涵盖DNA、RNA及蛋白质层面,可全面解析与癌症相关的癌蛋白并精准匹配药物,在美国NF1临床试验中,DOTA/DOTR检测对三线以上治疗失败的患者中,客观缓解率(ORR)可达到14.7%。



八、如何应对DoTa/DoTr检测出现跨适应症用药?

答:目前NCI-MATCH【选择治疗方案的分子分析计划】中提到,未来的精准医疗趁势,倾向于分子靶向检测结果来匹配抗肿瘤药物,而不受适应症的影响或限制。

DOTA/DOTR会有专门的医学团队进行报告解读,对药物按照用药指南、专家共识、会议总结以及文献报道进行排序,对跨适应症药物的用药提供有力依据。



九、DOTa/DOTr检测是否含免疫制剂检测?

答:免疫制剂效果评估需要综合TMB、MSI、PD-L1表达情况,DOTA/DOTR检测没有特地针对免疫制剂设计,即不含TMB/MSI信息,但DOTA/DOTR检测对样本中PD-L1蛋白(CD274)活性异常情况会报道及匹配药物;基因检测中只有大pannl 的检测有含有TMB(肿瘤突变符合)和MSI(微卫星不稳定)两项。



十、针对基因的检测是什么?为什么检测?

答:癌症是多基因突变的结果,基因检测可以从DNA水平上对已知的基因位点来检测基因的突变,插入/缺失,拷贝数变异,并预测靶向药物的疗效、化疗药物的敏感度; 同时也可作为药物动态监控、辅助诊断和预后判断的依据。在没有肿瘤精准检测前,肿瘤的治疗只能根据医生的临床经验进行轮翻试药,不仅耗时耗力,还耽误了患者的最佳治疗周期,而通过基因检测,就可以检测哪些基因出现了问题、什么药物的药效最好或者药物的毒副作用最小,相对于之前的临床标准治疗方案,可以有效提升患者的治疗效果。



十一、基因检测达到什么效果?

答:为临床医生的精准用药方案提供参考,实现疗效最大化和毒副作用最小化。



十二、基因检测的公司怎么样?

答:目前国内可开展的肿瘤基因检测,采用的都是Illumina高通量测序,用到的测序技术及比对的基因库、药物库及解读基本一致。目前,基因测序准确率可以达到99%以上。



十三、检测的程序怎么样?怎么获取检测结果?

答:NGS测序技术:一次性对几百万到十亿条DNA分子进行并行测序,又称为高通量测序,可以对一个物种的基因组,转录组,表观遗传组等进行深入,细致,全貌的分析,所以又被称为深度测序。





十四、单病种检测127基因的必要性。

答:基因检测分为院内及院外合作,院内合作主要是小套餐以试剂方式进入医院,一般为2基因、4基因、10基因,由医院开单,在院内检测,院内结算,有些列入了医保可报销部份检测费用,检测如有对应的基因发生突变,所使用的靶向药也可报销部份费用。此类检测主要为患者是否可以用某一类靶向药物而进行检测,不考虑肿瘤本身有多少基因发生了突变,也不考虑肿瘤患者真正适合哪类靶向药。

127 基因是对肿瘤中常见的58种靶向基因及69种化疗药物基因进行检测,它可以检测患者中多个基因突变,并匹配对应的靶向药物及化疗药物,真正做到了以基因突变来匹配药物的目的,而不是为了是否可以使用某款药物而检测的目的。

127基因检测可以对34种实体瘤主流、经常出现的127个基因进行检测,提供96种靶向药物信息,并提示可能出现的耐药信息;提供25种化疗方案中化疗单药或联药的毒副作用风险和有效性预测信息以及TMB/MSI等免疫治疗检测,属于综合性基因检测服务。


  
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